北京大学学报(医学版) ›› 2002, Vol. 34 ›› Issue (5): 457-463.

• 引进人才园地 • 上一篇    下一篇

细菌基因组结构:识别种系群的分子标志

刘树林,刘桂荣,李绍贤,刘葳峤,郑君芳,朱万孚,谷鸿喜,郭晓奎,马佳毓,K.E.Sanderson,周宇光,R.N.Johns ton   

  1. ^A加拿大卡尔加里大学医学院微生物系;北京大学基础医学院微生物系^B加拿大卡尔加里大学^C10458^D1%^A哈尔滨医科大学微生物学教研室^B哈尔滨医科大学^C6699^D2%^A加拿大卡尔加里大学生物系^B加拿大卡尔加里大学^C10458^D3%^A北京大学基础医学院微生物系^B北京大学^C1447^D4%^A中国科学院微生物研究所^B中国科学院微生物研究所^C25595^D5%^A加拿大卡尔加里大学医学院生物化学系^B加拿大卡尔加里大学^C10458^D6
  • 出版日期:2002-10-28 发布日期:2002-10-28

  • Online:2002-10-28 Published:2002-10-28

摘要: 目的:评价细菌基因组结构作为种系标志在细菌亲缘关系识别中的应用.方法:本研究选用3个属的细菌:Klebsiella, Neisseria 以及 Vibrio.为得到完整的基因组 DNA,整个提取的操作过程都在琼脂糖凝胶中进行.经proteinase K除蛋白后,基因组DNA置于TE缓冲液中待用.内切酶Ⅰ-CeuⅠ是本研究中主要的工具酶.酶切后的基因组DNA经脉冲场电泳分离.结果:Klebsiella的所有菌株(两个种,即Klebsiella pneumoniae 和 Klebsiella oxytoca)都有一个共同的基因组结构,而这一"Kle bsiella基因组结构"与Escherichia coli或Salmonella的基因组结构很相似, 其主要不同之处有3点:(1)有8个rrn操纵子(Esch erichia coli和Salmonella各有7个);(2)基因组较大;(3)Ⅰ-CeuⅠ E片段易位.以往学术界认为Neisseria具有高度易变和多态的基因组结构.而我们的研究结果表明,Neisseria的基本基因组结构是相对稳定的.我们比较研究了300株N. m eningitidis,结果仅仅发现了少数几个不同的基因组结构.其中Z2491株代表50%的群体 (Ⅰ型基因组结构),MC58株代表20%的群体(Ⅱ型基因组结构),N045株代表17%的群体 (Ⅲ型基因组结构).已知Z2491和MC58代表不同的种系群,所以我们认为我们所鉴别出的Ⅲ型及其他型基因组结构都相当于不同的种系群.Vibrio菌属中我们比较研究的有下列菌种: V . algi nolyticus, V. fluvialis, V. furnissii, V. harveyi, V. natriegens, V. parahaemoly ticus, 和 V. proteolyticus,这些细菌均有多态的基因组结构.结论 :细菌基因组结构有可能作为种系标志用于识别细菌的种系群.这一种系标志对于最终建立一个真正以种系关系为基础的细菌分类系统将会发挥重要作用.

关键词: 基因组结构, 种系群, Ⅰ-CeuⅠ

No related articles found!
Viewed
Full text


Abstract

Cited

  Shared   
  Discussed   
[1] 田增民, 陈涛, Nanbert ZHONG, 李志超, 尹丰, 刘爽. 神经干细胞移植治疗遗传性小脑萎缩的临床研究(英文稿)[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(4): 456 -458 .
[2] 卢恬, 朱晓辉, 柳世庆, 郑杰, 邱晓彦. 白细胞介素2促进宫颈癌细胞系HeLaS3免疫球蛋白G的表达[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(2): 158 -161 .
[3] 袁惠燕, 张苑, 范田园. 离子交换型栓塞微球及其载平阳霉素的制备与性质研究[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(2): 217 -220 .
[4] 徐莉, 孟焕新, 张立, 陈智滨, 冯向辉, 释栋. 侵袭性牙周炎患者血清中抗牙龈卟啉单胞菌的IgG抗体水平的研究[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(1): 52 -55 .
[5] 董稳, 刘瑞昌, 刘克英, 关明, 杨旭东. 氯诺昔康和舒芬太尼用于颌面外科术后自控静脉镇痛的比较[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(1): 109 -111 .
[6] 祁琨, 邓芙蓉, 郭新彪. 纳米二氧化钛颗粒对人肺成纤维细胞缝隙连接通讯的影响[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(3): 297 -301 .
[7] Jian-wei GU, Emily YOUNG, Zhi-jun PAN, Kevan B. TUCKER, Megan SHPARAGO, Min HUANG, Amelia Purser BAILEY. SD大鼠长期高盐饮食可导致其高血压并改变肾细胞因子基因表达谱[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(5): 505 -515 .
[8] 李宏亮*, 安卫红*, 赵扬玉, 朱曦. 妊娠合并高脂血症性胰腺炎行血液净化治疗1例[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(5): 599 -601 .
[9] 李伟军, 邢晓芳, 曲立科, 孟麟, 寿成超. PRL-3基因C104S位点突变体和CAAX缺失体的构建及表达[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(5): 516 -520 .
[10] 丰雷, 王玉凤, 曹庆久. 哌甲酯对注意缺陷多动障碍儿童平衡功能影响的开放性研究[J]. 北京大学学报(医学版), 2007, 39(3): 304 -309 .