人重组S100A8蛋白适配体的筛选和结构分析

摘要/Abstract

摘要： 目的：筛选人重组S100A8蛋白特异性的适配体。方法：采用配体指数级富集系统进化（systematic evolution of ligand by exponential enrichment，SELEX）技术，以人重组S100A8蛋白为靶蛋白，以微孔板为筛选介质，从体外合成的随机单链DNA文库中筛选其适配体。利用生物素-链霉亲和素-辣根过氧化物酶系统检测每轮单链DNA文库与靶蛋白的亲和力直至亲和力的上升趋于饱和，将最后一轮筛选产物克隆测序，并进行生物信息学分析。结果：经过11轮筛选，单链DNA文库与人重组S100A8蛋白的亲和力趋向稳定，将第11轮筛选产物克隆测序，对获得的30个适配体进行分析。一级结构分析显示30个适配体并无共同的保守序列，但有3对适配体序列完全一致。二级结构预测分析表明，茎环和口袋结构为主要的结构形式，提示其可能是适配体与人重组S100A8蛋白特异性结合的基础。根据茎环和口袋的相对比例可将30个适配体分为4组，其中第1组中35号适配体与人重组S100A8蛋白亲和力最高。结论：获得了与人重组S100A8蛋白特异性结合的适配体群，为后续适配体的应用研究以及S100A8蛋白功能的研究奠定了基础。

关键词: 钙粒蛋白A, SELEX适体技术, 适体, 核苷

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