北京大学学报(医学版) ›› 2002, Vol. 34 ›› Issue (1): 83-85.

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蛋白质、核酸序列信息的获取、管理和发布

尚彤,张其鹏,张丹,刘贝,谭耀麟   

  1. ^A北京大学心血管基础研究所,北京,100083^B北京大学^C1447^D1%^A清华大学电子工程系^B清华大学^C635^D2
  • 出版日期:2002-02-28 发布日期:2002-02-28

  • Online:2002-02-28 Published:2002-02-28

摘要: 目的:建立通用的蛋白质、核酸序列信息数据类型和数据库结构,为建立专用的生物医学信息数据库奠定基础.设计自动获取数据的软件,彻底改变手动获取数据的方式.方法:以美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立的GenBank数据库和欧洲分子生物信息学实验室(EBI)维护的Swiss-Prot数据库分别作为一级和二级数据库的信息来源;通过分析,设计新的数据模型;建立本地数据库.编写了专用软件从网上获取数据,并且进行分类整理,存入数据库,同时利用软件的管理和查询功能对于本地数据进行管理和检索.结果:建立核酸、蛋白质常用信息数据库,设计相关信息获取、管理软件.以心衰相关基因数据库为例,利用所设计系统实现专业生物信息数据库.提出网上发布的方案.结论:结合生物技术研究的需要,设计软件获取网上的生物信息数据,可以大大地提高效率.将不同的数据库数据结合起来,建立新的数据类型和数据分类,可以改进查询方式,并实现本地发布.

关键词: 数据库, 文献型, 生物医学工程, 信息存贮和检索

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