人程序化死亡分子5(PDCD5)核酸和蛋白质序列的数据发掘

北京大学学报（医学版） ›› 2003, Vol. 35 ›› Issue (4): 353-359.

人程序化死亡分子5(PDCD5)核酸和蛋白质序列的数据发掘

郑霙,马大龙

(北京大学人类疾病基因研究中心,北京 100083)

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2003-08-18 发布日期:2003-08-18

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2003-08-18 Published:2003-08-18

摘要/Abstract

摘要： 目的:以程序化死亡分子5(PDCD5)为靶分子,对其核酸与蛋白质序列进行生物信息学分析,为PDCD5功能的实验研究提供基础,同时也为人类功能基因的生物信息学分析提供新的技术路线.方法:利用数据库相似性搜索、同源物结构比较、表达谱分析和查询基因"邻居"等技术进行数据发掘和数据综合分析.结果:发现人PDCD5在12号和5号染色体上分别存在返座假基因(retropseudogene),小鼠1号染色体也存在小鼠PDCD5 cDNA的返座假基因.热自养甲烷杆菌的PDCD5同源物、泛素及核糖体蛋白S13具有与人PDCD5相似的折叠方式.线虫的PDCD5同源物、泛素及IAP(inhibitor of apoptosis proteins)分子等在表达谱拓扑图上属于同一基因簇成员,该基因簇与生物合成和蛋白质合成相关.PDCD5同源物在多个基因组中与多种核糖体蛋白相邻.结论:PDCD5存在2个拷贝的假基因.PDCD5除参与细胞凋亡外,预测还与泛素有功能相关性,并可能参与蛋白质的翻译调控.

关键词: 序列同源性, 生物信息学, TFAR19, PDCD5

郑霙, 马大龙. 人程序化死亡分子5(PDCD5)核酸和蛋白质序列的数据发掘[J]. 北京大学学报（医学版）, 2003, 35(4): 353-359.

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