北京大学学报(医学版) ›› 2003, Vol. 35 ›› Issue (z1): 62-65.

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SARS冠状病毒主要蛋白酶结构模建及活性部位运动性分析

刘士勇,裴剑锋,陈浩,祝小雷,刘振明,马文喆,贺风雷,来鲁华   

  1. (北京大学化学与分子工程学院,北京大学理论生物学中心,分子动态与稳态国家重点实验室,北京 100871)
  • 收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2003-05-31 发布日期:2003-05-31

  • Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2003-05-31 Published:2003-05-31

摘要: SARS冠状病毒3CL蛋白酶是病毒复制过程中的关键酶,有可能成为针对抗SARS药物研制的重要靶标.利用同源模建的方法建立了SARS冠状病毒3CL蛋白酶的结构模型,对于二聚体中蛋白质分子间相互作用分析表明该蛋白在溶液中有可能形成二聚体.利用分子动力学与多正则系综采样相结合的方法对于SARS冠状病毒3CL蛋白酶活性部位的两个环区进行了构象模拟,找到了两种代表性构象,预示着SARS冠状病毒3CL蛋白酶在催化过程中有可能伴随着构象变化.

关键词: SARS冠状病毒3CL蛋白酶, 同源模建, 二聚体, 构象变化

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