北京大学学报(医学版) ›› 2008, Vol. 40 ›› Issue (3): 270-272.

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乙型肝炎病毒表面抗原终止密码子的偏嗜性选择

李俊强,田敬华,刘峰,杜绍财   

  1. (1.北京大学人民医院,北京大学肝病研究所,北京 100044;2.北京地坛医院)
  • 收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2008-06-18 发布日期:2008-06-18

  • Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2008-06-18 Published:2008-06-18

摘要: 目的:探究乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg)终止密码子的存在状况及偏嗜性.方法:从GenBank中选取各基因型的参考序列共174例;使用生物软件BioEdit进行序列比对,应用RNAdraw构建并分析其RNA二级结构.结果:(1)在174例参考序列中,HBsAg的终止密码子共有TAA和TGA两种形式.其中TAA形式的有124例,占71.26%;TGA形式的有50例,占28.74%.(2)终止密码子的使用存在偏嗜性,并影响RNA的二级结构和蛋白质的编码氨基酸序列.结论:HBsAg终止密码子的使用偏嗜性客观存在,可能与进化过程中RNA结构和蛋白质功能的保守性相关.

关键词: 肝炎病毒, 乙型, 密码子, 终止, 序列分析

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