北京大学学报(医学版) ›› 2009, Vol. 41 ›› Issue (3): 353-360.
郭瑞芳1▲,臧师竹1,房静远2,张亮3,胡伏莲4,李文梅1,张经余1,吕有勇1△
摘要:
目的:鉴定能够特异性识别肿瘤生物学行为和预测肿瘤早期发生的分子标志谱,为胃癌早期诊断和有效防治提供实验依据和理论基础。方法:利用优化的70 mer的22K-Oligo基因芯片杂交和生物信息学分析,建立了胃癌(gastric cancer,GC)和癌旁形态学正常组织(normal appearing tissue,NAT)差异基因表达谱。通过设立以混合的正常胃黏膜组织作为共同参照(common reference,CR),将胃癌和配对癌旁形态学正常组织表达无明显差别的一类基因分离出来,这些基因主要是参与细胞增殖、代谢和分化过程的调控。在此基础上鉴定出一组与胃黏膜病变演化和细胞癌变早期相关的差异表达基因。结果:利用半定量RTPCR,免疫组织化学染色方法对差异表达基因进行了验证,获得了与芯片表达谱数据一致的结果。进一步的生物信息学分析和实验研究明确了3个有代表性的基因(EGR1、CYR61和ADAMTS1)在胃癌及癌旁形态学正常组织、异型增生、肠上皮化生和非癌患者正常胃黏膜组织中的表达变化。癌和配对形态学正常组织表达水平未见明显差异的这一组基因,在肠化和异型增生组织中,mRNA表达水平明显高于正常胃黏膜组织。结论:肿瘤患者癌旁形态学正常组织中的基因表达模式已经发生了改变。EGR1、CYR61和ADAMTS1基因过量表达参与胃黏膜病变的演化过程,这一组基因的异常表达可能是胃癌发生的早期事件之一。
[1] | 罗采南,李正芳,武丽君,陈海娟,杨春梅,徐文晖,刘小玲,唐薇,乔平,热娜·白合提亚. 类风湿关节炎不同分类标准的多中心临床比较[J]. 北京大学学报(医学版), 2020, 52(5): 897-901. |
[2] | 王明,李辉,王静,高嵩. 利用X射线衍射增强成像技术诊断肝纤维化[J]. 北京大学学报(医学版), 2018, 50(5): 899-904. |
[3] | 杨毅, 蔡宾, 樊东升. 肌萎缩侧索硬化模型鼠中microRNA-29b的表达[J]. 北京大学学报(医学版), 2015, 47(5): 733-736. |
[4] | 张静, 丁士刚, 杨雪玲, 王晔, 张贺军. 胃黏膜病理学改变、体重指数与血清ghrelin和瘦素关系的研究[J]. 北京大学学报(医学版), 2010, 42(5): 543-546. |
[5] | 何湘君, 张旗, 刘玉京, 潘秀英. 通过引物设计和提高退火温度提高实时定量PCR检测microRNA的特异性[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(6): 691-698. |
[6] | Jian-wei GU, Emily YOUNG, Zhi-jun PAN, Kevan B. TUCKER, Megan SHPARAGO, Min HUANG, Amelia Purser BAILEY. SD大鼠长期高盐饮食可导致其高血压并改变肾细胞因子基因表达谱[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(5): 505-515. |
[7] | 李文庆, 潘凯枫, 张阳, 张联, 马峻岭, 周彤, 李吉友, 王政, 苏英, 游伟程, . 胃癌高发区人群RUNX3表达与胃黏膜病变的关系[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(3): 348-352. |
[8] | 张旗, 何湘君, 刘玉京, 马丽萍, 潘秀英 . 实时定量PCR阵列检测小鼠大脑组织microRNA表达谱[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(2): 152-157. |
[9] | 郭春雨, 殷惠军, 蒋跃绒, 薛梅, 张璐, 史大卓. 急性心肌梗死大鼠心肌基因表达谱构建、鉴定及功能基因的研究[J]. 北京大学学报(医学版), 2008, 40(3): 251-257. |
[10] | 汪立, 石太平, 王兰, 于传飞, 曾令娥, 王京, 王露. 人类新基因RNF122的克隆、表达和亚细胞定位[J]. 北京大学学报(医学版), 2006, 38(3): 239-243. |
[11] | 胡振兴, 乔杰, 李美芝, 张小为, 陈咏健, 李蓉, 孙春玲. 多囊卵巢综合征相关基因的差异表达研究[J]. 北京大学学报(医学版), 2004, 36(6): 600-604. |
[12] | 刘正新, 陈宝雯, 杨桂彬, 张希全, 贾博琦. 幽门螺杆菌感染对慢性胃炎胃黏膜细胞增殖的影响[J]. 北京大学学报(医学版), 2004, 36(3): 297-299. |
[13] | 刘建湘, 刘新光, 王化虹, 李江. 大鼠短期十二指肠胃反流引起胃黏膜鸟氨酸脱羧酶表达增强[J]. 北京大学学报(医学版), 2003, 35(6): 671-672. |
[14] | 董秀云, 周丽雅, 林三仁, 茹炳根, 方敏. 小肠三叶因子保护胃黏膜促进溃疡愈合的实验研究[J]. 北京大学学报(医学版), 2003, 35(6): 639-641. |
[15] | 刘正新, 陈宝雯, 杨桂彬, 李江, 贾博琦. 幽门螺杆菌培养上清液对大鼠胃黏膜上皮细胞增殖的影响[J]. 北京大学学报(医学版), 2002, 34(4): 368-370. |
|