北京大学学报(医学版) ›› 2013, Vol. 45 ›› Issue (5): 782-786.

• 论著 • 上一篇    下一篇

新型MGB探针特异性检测变形链球菌

郑晖1,林久祥1△,杜宁2,陈峰2△   

  1. (北京大学口腔医学院·口腔医院 1.正畸科,2.中心实验室,北京100081)
  • 出版日期:2013-10-18 发布日期:2013-10-18

  • Online:2013-10-18 Published:2013-10-18

摘要: 目的:设计一种新型TaqMan®MGB探针,利用实时荧光定量PCR检测变形链球菌,提高PCR法检测变形链球菌的特异性,减少检测的假阳性。方法:提取 6种不同链球属细菌的DNA,分别进行巢式PCR和TaqMan® MGB实时荧光定量PCR,比较两种PCR方法检测变形链球菌的特异性。巢式PCR第1轮扩增的引物是细菌16S rRNA基因通用引物,第2轮扩增使用变形链球菌16S rRNA基因可变区序列的特异性引物。TaqMan® MGB实时荧光定量PCR的引物与第2轮巢式PCR特异性引物相同,设计的MGB探针序列与变形链球菌16S rRNA基因中特异性序列相匹配,不与其他细菌的基因序列匹配。将变形链球菌标准株的DNA样本从2.5 mg/L至0.16 μg/L 按5倍梯度稀释,制备出实时荧光定量PCR的标准曲线。结果:变形链球菌和格氏链球菌在巢式PCR中均扩增出282 bp的DNA片段,出现假阳性结果。TaqMan® MGB实时荧光定量PCR能定量检出变形链球菌标准株和临床株,不检出其他链球菌,比巢式PCR特异性更好。TaqMan® MGB实时荧光定量PCR对变形链球菌DNA的最低检出浓度为20 μg/L。结论:本研究设计出一种针对变形链球菌的TaqMan® MGB探针,建立利用TaqMan®MGB实时荧光定量PCR特异性检测口腔中变形链球菌的方法。

关键词: 寡核苷酸探针, 变形链球菌, 实时聚合酶链反应, RNA, 核糖体, 16S

[1] 何丽杰,张春艳,王静. NEAT1、miR-27a-3p在阿尔茨海默病患者血清和脑脊液中的表达关系[J]. 北京大学学报(医学版), 2024, 56(2): 207-212.
[2] 李文根,古晓东,翁锐强,刘苏东,陈超. 血浆外泌体miR-34-5p和miR-142-3p在系统性硬化症中的表达及临床意义[J]. 北京大学学报(医学版), 2023, 55(6): 1022-1027.
[3] 李嘉辰,赖展鸿,邵苗,金月波,高小娟,张科,侯儆,张燕英,栗占国,李玉慧. 抗Jo-1抗体在特发性炎性肌病临床分层及疾病谱中的意义[J]. 北京大学学报(医学版), 2023, 55(6): 958-965.
[4] 叶雨阳,岳林,邹晓英,王晓燕. 成牙本质方向分化牙髓干细胞外泌体形态及微小RNA表达谱特征[J]. 北京大学学报(医学版), 2023, 55(4): 689-696.
[5] 史佳琪,马莺,张奕,陈章健,贾光. 纳米二氧化钛颗粒对人肝癌细胞HepG2中circRNA表达谱的影响[J]. 北京大学学报(医学版), 2023, 55(3): 392-399.
[6] 周桥. 肿瘤病理学研究的进展和展望[J]. 北京大学学报(医学版), 2023, 55(2): 201-209.
[7] 许云屹,苏征征,郑林茂,张孟尼,谭珺娅,杨亚蓝,张梦鑫,徐苗,陈铌,陈雪芹,周桥. 转录通读环状RNA rt-circ-HS促进低氧诱导因子1α表达和肾癌细胞增殖与侵袭[J]. 北京大学学报(医学版), 2023, 55(2): 217-227.
[8] 包文晗,唐雯. 初诊IgA肾病患者的肠道菌群及其与疾病进展因素的相关分析[J]. 北京大学学报(医学版), 2023, 55(1): 124-132.
[9] 张璐,陈澄,翁梅婷,郑爱萍,苏美玲,王庆文,蔡月明. 狼疮肾炎患者肾小管间质损伤的自身抗体特征[J]. 北京大学学报(医学版), 2022, 54(6): 1094-1098.
[10] 张家赫,史佳琪,陈章健,贾光. 基于人消化道微生态体外模拟系统观察纳米二氧化钛对肠道菌群的影响[J]. 北京大学学报(医学版), 2022, 54(3): 468-476.
[11] 帅婷,刘娟,郭艳艳,金婵媛. 敲减长链非编码RNA MIR4697HG抑制骨髓间充质干细胞成脂向分化[J]. 北京大学学报(医学版), 2022, 54(2): 320-326.
[12] 娄雪,廖莉,李兴珺,王楠,刘爽,崔若玫,徐健. 类风湿关节炎患者外周血TWEAK基因启动子区甲基化状态及其表达[J]. 北京大学学报(医学版), 2021, 53(6): 1020-1025.
[13] 王晓,贺丹,李文婷,阿迪拉·斯依提,韩蕊,董颖. 144例维吾尔族与汉族女性子宫内膜癌微小RNA表达特点及临床意义[J]. 北京大学学报(医学版), 2020, 52(3): 570-577.
[14] 王婷婷,韩影,高芳芳,叶磊,张育军. 环状RNA circ-SOD2对肠上皮屏障和溃疡性结肠炎的作用[J]. 北京大学学报(医学版), 2019, 51(5): 805-812.
[15] 杨飞龙,洪锴,赵国江,刘承,宋一萌,马潞林. 基于长链非编码RNA的生物信息学分析构建膀胱癌预后模型并确定预后生物标志物[J]. 北京大学学报(医学版), 2019, 51(4): 615-622.
Viewed
Full text


Abstract

Cited

  Shared   
  Discussed   
No Suggested Reading articles found!