版纳微型猪近交系基因组中内源性逆转录病毒序列拷贝数分析

北京大学学报（医学版） ›› 2006, Vol. 38 ›› Issue (4): 370-374.

版纳微型猪近交系基因组中内源性逆转录病毒序列拷贝数分析

黄晓洁,陈苹,曾嵘,马康涛,曾养志,周春燕

(1.北京大学基础医学院生物化学与分子生物学系,北京 100083;2.云南农业大学版纳微型猪近交系研究所)

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2006-08-18 发布日期:2006-08-18

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2006-08-18 Published:2006-08-18

摘要/Abstract

摘要： 目的:检测分析版纳微型猪近交系基因组中内源性逆转录病毒(porcine endogenous retrovirus,PERV)序列的拷贝数,从而为猪源移植物的异种移植筛选理想供者.方法:用PERV的pol,env各亚型基因及envA/C重组体的特异性引物,对4个近交系亚系共50头以及5头欧洲大白猪的外周血单核细胞(peripheral blood mononuclear cell, PBMC)的基因组DNA进行了实时定量/半定量PCR检测及普通PCR检测.结果:所有版纳猪基因组中可特异扩增出pol,envA,envB片段,其平均拷贝数分别为(24.2±9.4),(13.1±8.4)和(16.4±9.8)个,但近交系不同亚系之间各片段扩增产物量比较差异具有统计学意义(P＜0.01).所有样品中无法扩增出envC片段以及envA/C重组体.结论:版纳微型猪近交系基因组内,PERV的envA、envB和pol序列拷贝数在近交系不同亚系间比较差异有统计学意义,不存在envC和envA/C重组体序列.

关键词: 猪, 内源性逆转录病毒, 动物, 近交系, 聚合酶链反应, 序列分析

黄晓洁, 陈苹, 曾嵘, 马康涛, 曾养志, 周春燕. 版纳微型猪近交系基因组中内源性逆转录病毒序列拷贝数分析[J]. 北京大学学报（医学版）, 2006, 38(4): 370-374.

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