北京大学学报(医学版) ›› 2012, Vol. 44 ›› Issue (3): 454-463.

• 论著 • 上一篇    下一篇

冬虫夏草的成熟伴随着冬虫夏草子座中多个基因突变型冬虫夏草菌表达的变化

高凌1, 李晓红2, 赵建晴2, 陆继红1, 赵家刚3, 朱佳石1,4,5,6△   

  1. (1. 如新华茂公司北京临床药理研究中心, 北京100088; 2. 博奥生物有限公司,北京102206; 3. University of California, San Diego School of Medicine, La Jolla, CA 92093, USA; 4. Nu Skin Center for AntiAging Research, Provo, UT 84601, USA; 5. 新疆石河子大学药学院,石河子832000; 6. 香港理工大学应用生物学和化学科技系,香港)
  • 出版日期:2012-06-18 发布日期:2012-06-18

  • Online:2012-06-18 Published:2012-06-18

摘要: 目的:检测冬虫夏草成熟过程中冬虫夏草菌转换突变和颠换突变基因型在子座中表达的动态变化。方法:采用MassARRAY单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)质谱基因分型法,根据冬虫夏草菌基因内转录间隔区(internal transcribed spacer, ITS)序列中大量散在的点突变,设计了8个SNP延伸引物,其中5个位于rDNA ITS1和ITS2段:067721-211,067721-240,067721-477,067721-531和067721-581,用于检验GC和AT偏倚基因型,但不区分两个AT偏倚基因型;另外3个延伸引物位于rDNA 5.8S段:067740-324,067740-328和067740-360,用于区分两个AT偏倚基因型。应用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱法(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight, MALDI-TOF)测定各个SNP位点的单核苷酸延伸反应,观察未成熟和成熟冬虫夏草子座中转换突变和颠换突变基因型表达的动态变化。结果:冬虫夏草子座rDNA的8个SNP位点的质谱图显示复杂的动态变化。067721-211位点的AT偏倚型等位基因的分子浓度明显高于GC偏倚型,但随着冬虫夏草的成熟,这个位点的AT型等位基因消失。多个SNP位点的质谱图中不仅显示转换突变的等位基因,颠换突变等位基因也有很高的检出率,有些甚至超过GC和AT偏倚基因型等位基因的峰高;而随着冬虫夏草的成熟,颠换突变等位基因的检出率和峰高趋于下降。在区分两个AT偏倚基因型的研究中,AB067744和AB067740两个基因型的等位基因同时存在于未成熟冬虫夏草子座中。随着冬虫夏草的成熟,AB067744基因型等位基因的峰高大幅度降低,而AB067740基因型等位基因的峰高大幅度升高。结论:在冬虫夏草子座中共存的至少5个冬虫夏草菌突变基因型的表达随着冬虫夏草的成熟呈现动态变化,这些突变基因型菌的存在和它们的动态变化对于冬虫夏草子座的萌发和成熟具有重要意义。

关键词: 冬虫夏草, 多态性, 单核苷酸, 突变, 成熟

[1] 钱锟,潘洁,朱文昊,赵晓一,刘畅,雍颹. 两种硅酸钙类材料用于成熟恒牙牙髓切断术的临床效果[J]. 北京大学学报(医学版), 2022, 54(1): 113-118.
[2] 朱小玲,李文静,王宪娥,宋文莉,徐莉,张立,冯向辉,路瑞芳,释栋,孟焕新. 细胞色素B-245α链及胆固醇酯转运蛋白基因多态性与广泛型侵袭性牙周炎易感性的关系[J]. 北京大学学报(医学版), 2022, 54(1): 18-22.
[3] 曹泽,王乐童,刘振明. 严重急性呼吸综合征冠状病毒2的Spike蛋白点突变后与受体蛋白质及潜在抗病毒药物结合能力的同源建模分析[J]. 北京大学学报(医学版), 2021, 53(1): 150-158.
[4] 刘建,王宪娥,吕达,乔敏,张立,孟焕新,徐莉,毛铭馨. 广泛型侵袭性牙周炎患者牙根形态异常与相关致病基因的关联[J]. 北京大学学报(医学版), 2021, 53(1): 16-23.
[5] 吴君怡,余淼,孙仕晨,樊壮壮,郑静蕾,张刘陶,冯海兰,刘洋,韩冬. 少汗性外胚层发育不良患者EDA基因突变检测及表型分析[J]. 北京大学学报(医学版), 2021, 53(1): 24-33.
[6] 鲍轶,莫娟芬. 同时性多原发肺腺癌组织编码转录因子ERG基因相同位点突变1例报告[J]. 北京大学学报(医学版), 2020, 52(5): 971-974.
[7] 田艳,朱军. p53 rs1625895基因多态性与弥漫大B细胞淋巴瘤预后相关性分析[J]. 北京大学学报(医学版), 2019, 51(5): 791-796.
[8] 康玉琦,张月苗,侯平,师素芳,刘立军,周绪杰,吕继成,张宏. IgA肾病易感基因遗传多态性的种族差异分析[J]. 北京大学学报(医学版), 2019, 51(3): 459-466.
[9] 张杰铌,宋凤岐,周绍楠,郑晖,彭丽颖,张倩,赵望泓,张韬文,李巍然,周治波,林久祥,陈峰. 中国唇腭裂患者Sonic hedgehog信号通路相关单核苷酸多态性的分析[J]. 北京大学学报(医学版), 2019, 51(3): 556-563.
[10] 张宽根,周雨禾,邵雅昆,梅放,由江峰,刘北英,裴斐. 肿瘤转移抑制基因LASS2/TMSG1 S248A突变体通过增加ATP6V0C表达促进前列腺癌的侵袭[J]. 北京大学学报(医学版), 2019, 51(2): 210-220.
[11] 王皓,刘洋,刘浩辰,韩冬,冯海兰. 先天性缺牙患者中BMP2基因突变检测及功能分析[J]. 北京大学学报(医学版), 2019, 51(1): 9-15.
[12] 尤柱,徐丽莉,李雪芬,张建运,杜菁,孙丽莎. 成釉细胞纤维瘤中BRAF突变基因的检测[J]. 北京大学学报(医学版), 2019, 51(1): 4-5.
[13] 刘蕊,翟佳羽,刘湘源,姚中强. 误诊为强直性脊柱炎的进行性假性类风湿发育不良1例[J]. 北京大学学报(医学版), 2018, 50(6): 1112-1116.
[14] 张晓东,刘德若. 肺腺癌新分类与表皮生长因子受体基因突变之间的关系[J]. 北京大学学报(医学版), 2018, 50(4): 640-644.
[15] 王丹丹,甘业华,马绪臣,孟娟红. ADAMTS14基因单核苷酸多态性与汉族女性颞下颌关节骨关节炎的相关性研究[J]. 北京大学学报(医学版), 2018, 50(2): 279-283.
Viewed
Full text


Abstract

Cited

  Shared   
  Discussed   
[1] 田增民, 陈涛, Nanbert ZHONG, 李志超, 尹丰, 刘爽. 神经干细胞移植治疗遗传性小脑萎缩的临床研究(英文稿)[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(4): 456 -458 .
[2] 郭岩, 谢铮. 用一代人时间弥合差距——健康社会决定因素理论及其国际经验[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(2): 125 -128 .
[3] 成刚, 钱振华, 胡军. 艾滋病项目自愿咨询检测的技术效率分析[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(2): 135 -140 .
[4] 卢恬, 朱晓辉, 柳世庆, 郑杰, 邱晓彦. 白细胞介素2促进宫颈癌细胞系HeLaS3免疫球蛋白G的表达[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(2): 158 -161 .
[5] 袁惠燕, 张苑, 范田园. 离子交换型栓塞微球及其载平阳霉素的制备与性质研究[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(2): 217 -220 .
[6] 徐莉, 孟焕新, 张立, 陈智滨, 冯向辉, 释栋. 侵袭性牙周炎患者血清中抗牙龈卟啉单胞菌的IgG抗体水平的研究[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(1): 52 -55 .
[7] 祁琨, 邓芙蓉, 郭新彪. 纳米二氧化钛颗粒对人肺成纤维细胞缝隙连接通讯的影响[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(3): 297 -301 .
[8] 李宏亮*, 安卫红*, 赵扬玉, 朱曦. 妊娠合并高脂血症性胰腺炎行血液净化治疗1例[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(5): 599 -601 .
[9] 李伟军, 邢晓芳, 曲立科, 孟麟, 寿成超. PRL-3基因C104S位点突变体和CAAX缺失体的构建及表达[J]. 北京大学学报(医学版), 2009, 41(5): 516 -520 .
[10] 丰雷, 王玉凤, 曹庆久. 哌甲酯对注意缺陷多动障碍儿童平衡功能影响的开放性研究[J]. 北京大学学报(医学版), 2007, 39(3): 304 -309 .