MassARRAY单核苷酸多态性MALDI-TOF质谱基因分型法检测未成熟冬虫夏草子座中多个冬虫夏草菌突变基因型

北京大学学报（医学版） ›› 2011, Vol. 43 ›› Issue (2): 259-266.

MassARRAY单核苷酸多态性MALDI-TOF质谱基因分型法检测未成熟冬虫夏草子座中多个冬虫夏草菌突变基因型

高凌1, 李晓红2, 赵建晴2, 陆继红1, 朱佳石1,3,4△

(1. 美国华茂公司北京临床药理研究中心, 北京100088; 2. 博奥生物有限公司, 北京 102206; 3. Pharmanex Research Institute, Provo UT84601, USA; 4. 新疆石河子大学药学院，石河子832000)

收稿日期:2010-04-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2011-04-18 发布日期:2011-04-18
通讯作者: 朱佳石

Received:2010-04-01 Revised:1900-01-01 Online:2011-04-18 Published:2011-04-18
Contact: ZHU Jia-Shi

摘要/Abstract

摘要：

目的：检测未成熟冬虫夏草子座中同时存在的多种突变基因型冬虫夏草菌。方法：采用MassARRAY单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）质谱基因分型法，根据冬虫夏草菌基因内转录间隔区（ITS）序列的大量散在点突变，设计8个SNP延伸引物，利用质谱测定各个SNP位点的单核苷酸延伸反应，检测未成熟冬虫夏草子座中与GC偏倚基因型（gb #AB067721）冬虫夏草菌相关的突变基因型。结果：GC偏倚基因型和两个AT偏倚基因型同时存在于未成熟天然冬虫夏草子座中。SNP基因分型法还检测到另外至少两个未知序列的突变基因型。结论：已知的3个冬虫夏草菌基因型的共存提示在冬虫夏草的子座萌发阶段和成熟过程中可能存在DNA转换点突变；另外两个未知序列的基因型的存在提示冬虫夏草中可能存在DNA颠换点突变。

关键词: 冬虫夏草, 基因型, 突变, 多态性, 单核苷酸

高凌, 李晓红, 赵建晴, 陆继红, 朱佳石, . MassARRAY单核苷酸多态性MALDI-TOF质谱基因分型法检测未成熟冬虫夏草子座中多个冬虫夏草菌突变基因型[J]. 北京大学学报（医学版）, 2011, 43(2): 259-266.

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